pymol是一款极其强大的3D分子建模分析软件，它集成了最新的光线追踪技术，并包含丰富的小工具，可以让用户轻松构建分子模型。现在可以根据用户的需求构建各种规格的3D分子模型。该版本是专门为大学用户准备的。

【软件特色】

该分子可视化系统可以对蛋白质、其密度、轨迹和表面进行3D 详细分析。

原生Retina 分辨率/4K 显示支持

新的APBS 插件面板

具有语法突出显示功能的pymolrc 脚本编辑器

停靠/取消停靠和重新定位特定面板（构建器、反馈浏览器、音量编辑器）

支持触控板手势（捏合放大/缩小、Z 轴旋转）

用于打开MAE 文件、MTZ 文件、地图和轨迹文件的专用对话框

【安装教程】

在Windows系统上运行pymol需要Python环境和PMW模块。

Pymol 是通过Python 包（Python Wheel）安装的，因此在开始之前，您需要根据系统的位数（32 位或64 位）和Python 版本选择pymol 包。

例如，如果您的系统是Windows 64 位，并且您的系统上已经（或计划安装）Python 3.7，则您有两个选择： pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64 。whl或pymol-2.4 .0a0-cp37-cp37m-win_amd64.whl，对应的版本为pymol 2.3和pymol 2.4。

安装Python环境

1. 如果您的系统上已有Python环境，请跳过此步骤。您可以使用命令行python -V 检查Python 版本号。

2.在Windows版Python官网输入安装包

3. 请注意，安装包必须与您的Windows系统位数相对应。 x86对应64位系统。系统是64位，4.所以安装包看起来像这样：Windows x86-64executableinstaller

5.完成后，双击安装。请务必选中将Python 添加到环境变量。否则，后续的命令行操作将会遇到问题。

6、如果安装成功，按Win+R、cmd进入命令行输入python V查看Python版本号。这也说明安装成功了。如果您收到错误“Python不是内部或外部命令、可运行程序或批处理文件”，则意味着Python的地址尚未添加到您的环境变量中。

安装PMW

命令行类型： python -m pip install pmw

出现提示说明pmw安装成功。 pmw-2.0.1已成功安装。

并安装pymol 包

根据系统位数和Python版本选择特定的pymol包，并将其放置在特定磁盘的根目录下。这里，我们选择安装pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl并将其放置在D:/root目录下。

在命令行中，将盘符切换为D:驱动器，然后输入命令python -m pip install pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl。

提示安装成功

找到pymol主程序

本文中pymol的主程序地址为：C:\Users\Python37\Scripts\pymol.exe

红色背景的部分应与各种计算机设置和Python版本相匹配。